Le funzionalità di Pitagora sono articolate come segue:

• Gestione anagrafiche
• Gestione didattica alunno
  - Gestione voti
  - Gestione assenze e giustificazioni
  - Gestione sanzioni
  - Gestione pagelle
  - Gestione corsi complementari
  - Gestione storico
  
• Gestione Comunicazione con la famiglia
  - L’orario delle lezioni con i relativi aggiornamenti
  - L’orario di ricevimento dei professori
  - Prenotazione colloqui
  - Circolari
  - Forum privato genitore-docente
  - News
  
• Report: area dove è possibile estrapolare i dati relativi agli alunni ed esportarli in excel
  
• Gestione scrutini: modulo per la gestione efficiente della procedura degli scrutini
  - Gestione coordinatori di classe
  - Gestione apertura chiusura scrutini
  - Inserimento proposte di voto
  - Gestione delle assenze
  - Gestione dei crediti e dei debiti
  - Creazione tabellone finale
  - Gestione promozioni
  
• Gestione circolari e news
  
• Piattaforma di e-learning: piattaforma di e-learning con il duplice scopo di facilitare i corsi di aggiornamento dei docenti e di dare un servizio da parte della scuola alle famiglie degli alunni
  
• Forum: area dove è possibile dibattere su argomenti di interesse e utilità per gli utenti della scuola
  
• Creazione dell’orario scolastico: modulo per la creazione dell’orario scolastico di inizio anno
  
• Sicurezza: I servizi di e-security consentono agli studenti un accesso sicuro alla rete evitando che vengano in contatto con contenuti dannosi; permettono di proteggere le infrastrutture informatiche della scuola e proteggono da intrusioni sui sistemi che dai virus. Assieme a questo tipo di servizi vengono forniti sistemi evoluti di gestione della posta elettronica e di backup dei dati